阴道炎患者一般不能直接做小阴唇手术，需先控制炎症，待炎症得到控制和改善后再进行手术。
如果阴道炎未得到有效治疗，处于急性炎症期，如细菌性、霉菌性、滴虫性阴道炎活动期（分泌物增多、瘙痒灼痛），手术可能加重感染，导致伤口溃烂、瘢痕增生，还可能引起炎症上行感染，增加宫颈炎、子宫内膜炎、输卵管炎、盆腔炎等妇科炎症的发生风险。
若阴道炎病情得到控制，复查白带常规连续2次阴性，或者仅为HPV阳性或支原体/衣原体感染（无临床症状），可在术前3天预防性使用抗生素，术中加强消毒，再考虑进行小阴唇手术。